לפי מקורות בכירים בביטחון ישראלים, מספר גורמים טרוריסטיים מתכנסים בדרום סוריה ומתכננים פיגועים נגד ישראל מהאזור הזה. דבר זה הוביל למבצע צבאי ישראלי ב-28 בנובמבר בכפר בית ג'אן, דרומית לדמשק.
במהלך המבצע, כוחות ישראליים פשטו על הכפר ועצרו שלושה פעילים מארגון "אל-ג'מאע אל-אסלאמיה", שלפי המודיעין תכננו פיגועים נגד ישראל, כולל ירי רקטות לעבר רמת הגולן. העצורים, לפי הדיווחים, הודו במהלך החקירה כי ארגונם קשור לפעילויות טרור הקשורות לאיראן, חיזבאללה וחמאס.
במהלך הפשיטה נתקלו כוחות ישראלים בהתנגדות וירי חי, מה שגרם לפציעות של שישה חיילים ישראלים. לפי התקשורת הסורית, 20 תושבים נהרגו בחילופי אש, חלקם היו חמושים.
מקורות פוליטיים בכירים ציינו כי לאחר האירוע, ישראל העבירה דרך ארצות הברית מסרים חריפים למשטר הסורי החדש תחת אחמד אל-שרעה, בטענה שישראל לא תסבול הקמת ארגוני טרור בדרום סוריה המתכננים פיגועים נגד ישראל וכי זו אחריות סוריה לסכל קבוצות אלו, אחרת ישראל תפעל בעצמה.
מקורות אלה ציינו בנוסף כי איחוד גורמי הטרור בדרום סוריה מפחית את הסיכויים להסכם ביטחוני בין ישראל לסוריה ומדגיש כי לשרעה אין שליטה אפקטיבית על כל חלקי המדינה.
משרד החוץ הסורי גינה את המתקפה הישראלית על בית ג'אן, וכינה אותה "פשע מלחמה מוחלט בכל היבטיו" והזהיר כי "המשך התוקפנות הפלילית הזו מסכן את הביטחון והיציבות באזור."
מקורות ביטחוניים בכירים בדרום סוריה דיווחו כי קבוצות טרור שונות מתמקמות באזור, כולל הג'יהאד האסלאמי הפלסטיני, אלמנטים המזוהים עם חות'ים מ"אנסאר אללה" בתימן, דאעש ואלמנטים מאל-ג'מאע אל-אסלאמיה.
בנוסף, מספר שבטים בדואים סונים עם אידיאולוגיות ג'יהאדיסטיות פועלים בדרום סוריה, המעורבים בהברחת סמים ונשק.
חלק מהשבטים הללו השתתפו בטבח בני הקהילה הדרוזית בסוויידה לצד כוחות נאמנים לאל-שרעה.
"אל-ג'מאע אל-אסלאמיה" היא ארגון לבנוני שנשיא ארה"ב דונלד טראמפ הנחה את מזכירי המדינה והאוצר לשקול לכלול ברשימת "ארגוני טרור זרים המזוהים עם האחים המוסלמים."
הקבוצה נוסדה בשנת 1964 כסניף של האחים המוסלמים בלבנון ובהמשך התרחבה לסוריה. הזרוע הצבאית שלה נוסדה בשנות ה-80 ומאז פועלת בשיתוף פעולה עם ארגוני טרור נוספים נגד ישראל, כולל חמאס בלבנון ובסוריה, וחזבאללה בלבנון.
חבר הפרלמנט הלבנוני עמד אל-חוט, חבר אל-ג'מאע אל-אסלאמיה, הכחיש טענות ישראליות בנוגע למעצר פעילי ארגונו בבית ג'אן. ב-28 בנובמבר אמר לאל-קודס אל-ערבי: "המידע שפרסמה ישראל שגוי. לארגון שלנו אין פעילות מחוץ לשטח לבנון."
לגבי בחירת ישראל להאשים במפורש את הארגון בפעילות בסוריה, אמר: "הדבר נעשה כדי להצדיק את ההחלטה האמריקאית שהכריזה על האחים המוסלמים כארגון טרור, החלטה שמונעת לחלוטין ממניעים פוליטיים וחסרת בסיס משפטית."
הפעילות הצבאית הישראלית בדרום סוריה הגבירה את המורכבות הביטחונית באזור. ישראל גם טוענת שמשטרו של אל-שרעה אינו מונע הברחת נשק מאיראן לחיזבאללה בלבנון דרך אזור זה. מסיבה זו, בכירים במערכת הביטחון הצהירו כי ישראל אינה סומכת על אל-שרעה בנוגע למאמצי המאבק בטרור.
הם סבורים שישראל חייבת כעת לפעול לחיזוק שליטתה הצבאית בדרום סוריה ולהקים מסדרון יבשתי לבעלות בריתה הדרוזים בסווידה. לפי מקורות אלו, אל-שרעה חלשה וחסרה שליטה על חלקים משמעותיים מסוריה, במיוחד בדרום.